Sama dengan Valon Behrami, Shaqiri juga lahir di Yugoslavia. Orang tuanya berasal dari Kosovo Albania. Selama perang Balkan di Kosovo, rumah pamannya dibakar sedangkan rumah keluarganya diruntuhkan. Semua harta kekayaan keluarga Shaqiri dirampas.

Situasi ini membuat keluarga Shaqiri memutuskan untuk mengungsi ke Swiss pada 1992. Di Swiss, Shaqiri tinggal tak jauh dari lapangan sepak bola klub SV Augst.

Shaqiri pun bermain untuk tim remaja SV Augst dan FC Basel. Shaqiri kemudian mendapat kontrak profesional dan memulai debutnya bersama FC Basel pada 2009.

Setelah dua musim, dia pindah ke klub raksasa Jerman, Bayern Munchen. Di klub ini dia merasakan gelar juara Liga Champions.

Di timnas Swiss, Shaqiri telah menjadi pemain reguler sejak 2009. Rusia 2018 merupakan Piala Dunia ketiganya.

Tak berbeda dengan Behrami, Shaqiri juga sangat bangga dengan tempat kelahirannya. Tiap kali bermain, Shaqiri selalu memakai sepatu dengan jahitan bendera Swiss, Kosovo, dan Albania.