Dua menit babak kedua berjalan, Belanda kembali mendapatkan tendangan penalti usai Wout Weghorst dilanggar Enrico Pepe pada area terlarang.
Gakpo yang kembali maju sebagai eksekutor menyelesaikan tugas dengan sempurna. Kali ini, ia mengarahkan bola ke posisi kiri gawang.
Gakpo benar-benar menjadi bintang dalam laga itu usai memberikan assist pada gol Reijnders yang dicetak di menit ke-57.
Belanda akhirnya menutup pertandingan dengan keunggulan 4-0 melalui gol Memphis Depay pada menit ke-90+3.
Mantan pemain Barcelona itu menyambut umpan Denzel Dumfries dari sisi kanan dengan sundulan.
Dengan hasil itu, kini Belanda semakin nyaman di puncak klasemen sementara dengan 13 poin.
Skuad asuhan Ronald Koeman tersebut unggul tiga angka dari Polandia yang menempati urutan kedua.
Malta XI: Henry Bonello, Ryan Camenzuli, Kurt Shaw, Matthew Guillaumier, Joseph Mbong, Ilyas Chouaref, Teddy Teuma, Irvin Cardona, Enrico Pepe, Juan Corbolan, Alexander Satariano.
Pelatih: Emilio De Leo
Belanda XI: Bart Verbruggen, Jurrien Timber, Virgil van Dijk, Ryan Gravenberch, Wout Weghorst, Cody Gakpo, Jeremie Frimpong, Tijjani Reijnders, Micky van de Ven, Frenkie de Jong, Denzel Dumfries.
Pelatih: Ronald Koeman