Meski memiliki darah Kamerun, Ekitike memilih membela Prancis. Ia telah mencatat 11 penampilan untuk Timnas U-20 dan U-21, dengan lima gol dari lima laga di level U-21.
Maret lalu, Ekitike mencetak hattrick saat Prancis U-21 menang 5-3 atas Inggris dalam laga persahabatan di Lorient.
Pertandingan ini juga melibatkan Harvey Elliott, yang kini menjadi rekan setimnya di Liverpool.
Tak lama setelahnya, Ekitike juga mencetak gol indah dari luar kotak penalti ke gawang Tottenham dalam perempat final Liga Europa.